Γενικά, τα πεπτίδια περιέχουν δύο έως εννέα αμινοξέα. Ανάλογα με τον αριθμό των αμινοξέων στο πεπτίδιο, υπάρχουν διάφορα ονόματα για το πεπτίδιο, όπως διπεπτίδιο, τριπεπτίδιο, τετραπεπτίδιο, πενταπεπτίδιο κ.λπ. Τα πεπτίδια που αποτελούνται από τρία ή περισσότερα μόρια αμινοξέων ονομάζονται πεπτίδια, με μοριακό βάρος κάτω από 10000 Da. Μπορούν να περάσουν από ημιπερατές μεμβράνες και δεν καθιζάνουν από το τριχλωροξικό οξύ και το θειικό αμμώνιο. Ορισμένη βιβλιογραφία αναφέρεται επίσης σε πεπτίδια που αποτελούνται από 2-10 αμινοξέα ως ολιγοπεπτίδια (πεπτίδια μικρού μορίου). Τα πεπτίδια που αποτελούνται από 10 έως 50 αμινοξέα ονομάζονται πεπτίδια. Ένα πεπτίδιο που αποτελείται από 50 ή περισσότερα αμινοξέα ονομάζεται πρωτεΐνη, με άλλα λόγια, μια πρωτεΐνη μερικές φορές αναφέρεται ως πολυπεπτίδιο. Τα πεπτίδια, γνωστά και ως πεπτίδια, ανακαλύφθηκαν τον 20ο αιώνα.
